绒毛膜癌的检查诊断是不困难的，但是苏州东吴中西医结合医院的医生表示，在诊断绒毛膜癌中，绒毛膜癌容易与某些疾病产生混淆：

　一、恶性葡萄胎  一般认为恶葡只发生于葡萄胎后而绒毛膜癌可发生于足月产后、流产后（包括宫外孕、自然流产或人工流产）。继葡萄胎后恶变者，绒毛膜癌及恶葡均有可能。但在发生时间上有差异。苏州东吴中西医结合医院的经验，葡萄胎排出后半年内恶变者，绝大部分（96.5％）为恶性葡萄胎，一年以上恶变者绝大部分（92.85％）为绒毛膜癌。6个月至1年间发生者恶葡与绒毛膜癌各占半数。故就一般论，间隔时间愈长，绒毛膜癌的可能性愈大。

　二、合体细胞子宫内膜炎  足月产后，特别是流产或葡萄胎排出后，刮宫或切除子宫病检可在浅肌层内尤其是胎盘附着部位，可见有散在的滋养细胞（以合体滋养细胞为主）及炎性细胞，乍看好象肿瘤图象，但深肌层亚无浸润。血或尿内hCG测定亦多为阴性。故不属于滋养细胞疾症范围。一般经过有效刮宫后即可逐渐恢复正常。认为合体细胞子宫内膜炎一词亚不适当，因参与良性侵蚀的细胞为单核，而非合体与多核，且无明显的炎症过程。

　三、滋养细胞假性瘤  有种种名称，除滋养细胞假性瘤外，还有合体细胞瘤，非典型绒毛膜癌，均指组织学与临床不具有典型绒癌现象，亦不转移之“持续型良性绒毛膜侵蚀病变”，为胎盘附着处合体滋养细胞反应性增生，形成瘤状。在组织学上，合体滋养细胞也每每表现出多形性，也出现大的奇形怪状的核。不存在绒毛结构。与绒癌鉴别是困难的，但根据无核分裂象、缺乏细胞滋养细胞亚没有侵犯子宫深肌层而造成破坏的倾向等，可与绒癌鉴别。